Vanunu je bil leta 1986 obsojen na 18 let zapora, ker je britanskemu časopisu Sunday Times razkril podrobnosti o notranjosti izraelske jedrske centrale Dimona, kjer je bil nekdaj zaposlen.

V času, ko je bil v zaporu, je postal znan po vsem svetu. V domovini je v veliki meri še vedno osovražen, saj se je malo pred ugrabitvijo v Italiji, od koder so ga na skrivaj prepeljali nazaj v Izrael in zaprli, spreobrnil v krščanstvo.

55-letni znanstvenik je bil leta 2004 pogojno izpuščen na prostost, vendar so mu oblasti prepovedale stike s tujci in novinarji ter potovanja v tujino. Od takrat je bil večkrat aretiran, ker je kršil ta pravila. V zadnjem primeru je bil zaprt za tri mesece, ker je bil v stiku z novinarji in drugimi tujci, poroča ameriška tiskovna agencija AP.